上海证券交易所下设办公室、人事部（党委组织部）、党委办公室（党委宣传部）、纪检监察办公室、交易管理部、发行上市部、上市公司监管一部、上市公司监管二部、会员部、债券业务部、国际发展部、基金业务部、衍生品业务部、市场监察部、法律部、投资者教育部（企业培训中心）、系统运行部、技术开发部、技术规划与服务部、信息中心、北京中心、财务部、风控与内审部、资本市场研究所、自贸区交易平台筹备工作小组、基建工作小组、花桥基地工作小组等内设部门或临时工作小组，以及全资子公司——上海证券通信有限责任公司、上证所信息网络有限公司、上证金融服务有限公司，通过它们的合理分工和协调运作，有效地担当起证券市场组织者的角色。此外，上海证券交易所还控股或参股了20家公司机构，大大拓展了上交所的服务范围。
经过二十五年的快速成长，上海证券交易所已发展成为拥有股票、债券、基金、衍生品四大类证券交易品种的，市场结构完整的证券交易所；拥有可支撑上海证券市场高效稳健运行的，世界先进的交易系统及基础通信设施；拥有可确保上海证券市场规范有序运作的，效能显著的自律监管体系。依托这些优势，上海证券市场的规模和投资者群体也在迅速壮大。2014年，沪市上市公司家数达995家，总市值24.4万亿元，全年累计成交金额37.56万亿元，日均成交达1533亿元，股市筹资总额达3962.59亿元；债券市场挂牌只数达2603只，托管量2.29万亿元，累计成交86.68万亿元；基金市场上市只数达75只，总市值2084亿元，累计成交37478亿元。投资者开户数量已达12317万户。